La alteración de la barrera mucosa intestinal puede ser causada por virus, bacterias, fármacos o inflamación, y provoca un aumento de permeabilidad de la mucosa intestinal con pérdida de sales, mayor capacidad de reacción de las terminaciones nerviosas con más contracciones intestinales (calambres dolorosos) y pérdida del equilibrio de la flora bacteriana (microbiota).

Todo esto da como resultado diarrea, dolores abdominales, malestar, riesgo de deshidratación.